Moleculaire biologie
Laatst aangepast 09/13/2019
■ Verantwoordelijke Biologen: Ina Benoy, Davy Vanden Broeck & Johan Beert
■ Verantwoordelijke Patholoog anatoom: John-Paul Bogers
■ Hoofdlaborant: Brenda Gabriëls

Op de afdeling moleculaire diagnostiek worden dagelijks +/- 10.000 PCR reacties uitgevoerd voor het opsporen van verschillende types micro-organismen en genetische afwijkingen. De afdeling is sterk geautomatiseerd en maakt gebruik van verschillende pipetteerrobotten, extractieautomaten en real-time PCR analyzers.

Opsporen, typeren en kwantificeren van HPV DNA dmv real-time PCR
Besmetting met kwaadaardige (hoog risico) HPV types liggen aan de oorzaak van baarmoederhalskanker.
Sinds 1997 wordt in het laboratorium het humaan papillomavirus(HPV) opgespoord door middel van moleculaire technieken. De opsporing en typering van HPV gebeurt op een deel van de cellen van het baarmoederhalsuitstrijkje dat afgenomen werd en gefixeerd in vloeibaar milieu(ThinPrep PreservCyt oplossing, Hologic).

Vanaf 2006 is de volledige HPV-typering geautomatiseerd. DNA wordt geïsoleerd uit de restcytologie met behulp van de STS en MTA extractierobot (Hologic). Voor de typering en kwantificatie van de verschillende types HPV wordt gebruik gemaakt van een in-house ontwikkelde real-time PCR-techniek (Janus, PerkinElmer en LightCycler480, Roche).

Opsporen Chlamydia trachomatis en/of Neisseria gonorrhoeae DNA
DNA afkomstig van Chlamydia trachomatis en/of Neisseria gonorrhoeae wordt opgespoord in first-voided urine en urethrale/vaginale wissers via de real-time PCR-techniek gebruik makende van het M2000 systeem van Abbbott (M2000RT en M2000SP, Abbott).

Opsporen Trichomonas vaginalis DNA
De opsporing van Trichomonas vaginalis DNA gebeurt via een in-house ontwikkelde real-time PCR techniek op de LightCycler480 (Roche).

Opsporen Herpes simplex DNA / Varicella zoster DNA
De opsporing van Herpes simplex DNA en Varicella zoster DNA gebeurt via de real-time PCR kits van Saccace op de LightCycler480 (Roche).

Opsporen, kwantificeren en genotypering van Hepatitis C RNA
Opsporing, kwantificering en genotypering van Hepatitis C RNA gebeurt met de kits van Abbott op het M2000 systeem (M2000RT en M2000SP, Abbott).

Opsporen en kwantificeren van Hepatitis B DNA
Opsporing en kwantificering van Hepatitis B DNA gebeurt met de kit van Abbott op het M2000 systeem (M2000RT en M2000SP, Abbott).

Opsporen van Factor V Leiden Mutatie en Factor II Mutatie
De opsporing van Factor V Leiden en Factor II Mutatie gebeurt mbv een kit van Roche op de LightCycler480(Roche).

Foetale aneuploïdie screening voor chromosomen 13, 18 en 21 (Veriseq, Illumina).


Voornaamste analyse-apparatuur

NucliSENS EasyMAG (Biomérieux)
LightCycler480 (Roche)
■ M2000rt (Abbott)
■ M2000sp (Abbott)
■ STS (Hologic)
■ MTA Cervista (Hologic)
Janus (Perkin Elmer)
■ PCR toestel I Cycler (Biorad)
■ Agilent Bioanalyser (Agilent Technologies)
NanoDrop ND-1000 (Isogen Life Science)
Veriseq (Illumina)

MTA Cervista (Hologic)
STS (Hologic)

Janus (Perkin Elmer)

Janus (Perkin Elmer)

M2000sp (Abbott)

M2000sp (Abbott)

M2000rt (Abbott)

NanoDrop ND-1000 (Isogen Life Science)
NucliSENS EasyMAG (Biomérieux)
Veriseq (Illumina)